在第(🤳)二次新吉恩战争、(🔷)别名(🥅)“夏亚的叛乱”终结后，地球圈取(🚜)得了(🥍)短暂的和平(🥠)。这之后(👣)3年，宇(👐)宙(🚊)世纪(🥝)0096年。在工业(👦)殖民地“工业7号”上(⚫)进(🧦)行了一项秘密交涉。内容为－－被认(🈹)为(🤳)是地球联(🥫)邦政府(📫)暗中操控的“比斯特财(🎐)团”将把最(🕹)高机(🍡)密(💆)“拉普拉斯之箱”交给新吉(🤝)恩的残党军“袖付”。另一方面，在安纳海姆工业专门学校就读的少(🤝)年(🙀)巴纳吉·林克斯遇见了自称为奥黛丽·本的少女（实(⬆)为旧吉恩公国次男多兹鲁·扎比之女，美耐(🦐)巴·(📀)扎(💸)比(🧐)）奥黛丽为了制(🛤)止新的战争爆发，必须组织“拉普拉(🌆)斯之箱”的交易。巴(🐀)纳吉在数次(🛵)帮助奥黛丽之后，逐渐(🚑)被她所吸引。随后，地球联(🍇)邦察觉了这起交(🏋)易，并进行军事介(💨)入，工(🗯)业殖民地随(⚫)即化为(🔋)一片(🥀)火海。巴纳吉和同(📠)伴一边避难(😒)一边寻找着(📘)奥(🗼)黛丽，而出现(👘)在他面前的是比斯特财团的(😇)当家卡迪阿斯·比斯特。奄奄一息的卡迪阿斯将出生的(🛂)秘密告诉了(🤷)巴纳吉，并且将箱之钥匙－－“机动战(🏉)士高达独角兽”托付给他。随后(🕎)，一场围绕“拉普拉斯之(🔋)箱”的战争开始了……
